RAxML

RAxML - это алгоритм филогенетического анализа с помощью метода максимального правдоподобия. Единственный в мире качественно распараллеленный алгоритм филогенетического анализа генов и белков (множество моделей) с помощью метода максимального правдоподобия. Stamatakis A. RAxML-VI-HPC: maximum likelihood-based phylogenetic analyses with thousands of taxa and mixed models. Bioinformatics. 2006 22:2688-2690.